3dslicer中文版下载,3dslicer使用教程
翻译谷歌表单SlicerJupyter
SlicerJupyter 3D切片器扩展允许从JupyterNotebook使用该应用程序。
演示视频：https://youtu.be/OZ3 _ crx 2 QM(这个我也没看到。)
用法运行插件有两种方式：
1.用
Binder
运行。您可以使用此选项快速入门。不需要安装或设置，只需点击下面的链接，然后在您的Web浏览器中通过JupyterNotebook开始使用Slicer。活页夹链接
当您单击该链接时，
Binder
将在其云服务器上启动带有SlicerJupyter扩展的3D Slicer。Binder
是免费服务，服务器资源非常有限。同样，没有对图形用户界面的交互式访问。因此，该选项仅推荐用于测试、演示或简单计算或可视化。2.在你自己的电脑上运行Slicer和Jupyter。在你自己的电脑上安装切片器和Jupyter。安装Python和JupyterNotebook。安装Anaconda(推荐)或任何其他Python发行版(参见这里的安装说明)。可以选择任意Python版本和任意位数(建议用Python 3制作，建议64位)没有必要将Python添加到PATH环境变量或者注册为默认Python。安装3D Slicer，启动它，然后在其扩展管理器中安装SlicerJupyter扩展，并通过复制和粘贴以下行来重新启动3D Slicer，在3D Slicer的Python控制台中安装Python软件包：importosifos . name== nt :# Python-3.6 for Windows没有官方的pyzmq轮，因此我们必须手动安装pip _ Install( 3https://files . Python hosted . org/packages/94/E1/13059383d 21444 CAA 16306 b48 c 从pillow pip _ Install(-upgrade pillow-force-reinstall )pip _ Install( ipywidgets pandas ipyevents ipycanvas )安装切片器jupyter内核切换到3D切片器中的jupyter kernel模块单击“将命令复制到剪贴板”将内核安装命令复制到安装了Jupyter的Python环境中的剪贴板启动命令提示符，然后粘贴并运行内核安装命令以安装Python软件包` Python-m pip Install Jupyter ipywidgets pandas ipycanwas ipyevents for dynamic Slicer view display，方法是在已安装的Python环境中运行以下命令对于JupyterLab，请运行以下附加命令：
conda Install-c conda-forge nodejspip Install ipywidgets Ipyevents ipycanvasjupyter Lab Extension Install @ jupyter-Widgets/Jupiter Lab-Manager Jupiter Lab Extension Install @ Jupiter-Widgets/Jupiter Lab-Manager Ipyevents Start JupyterNotebook。例如，通过运行jupyter-notebook可执行文件。点击这里查看使用Anaconda的安装步骤视频：
我看不到。
用笔记本中的切片器新建一个笔记本，选择切片器4.x内核(例如切片器4.11)。当请求内核启动时，Jupyter会自动打开一个新的切片器实例。当请求关闭内核时，此切片器实例将自动关闭。
内核启动时，会显示“内核正在启动，请稍候…”的消息。最多几十秒后，Slicerkernel应该会成功启动。
快速测试-显示笔记本中的视图内容：
将jupyternebookslib导入为slicernbslicernb.viewdisplay()尝试使用交互式视图小部件：slicernb。ViewInteractiveWidget()按Tab键自动完成。单击Shift Tab显示方法文档(多次单击可显示更多详细信息)。注意：方法名必须完整(可以使用Tab键来完成名称)，光标必须在名称内或名称后(不在括号内)。例如，键入slicer.util.getNode，然后按Shift Tab。示例您可以在此处查看示例SlicerNotebook开始使用。
开发人员指南：为启用了Qt5和VTK9的新切片器构建扩展。
安装Jupyter
mkvirtualenv-p python 3.6 jupyter _ env #创建并激活虚拟环境点安装朱皮特安装内核jupyter-kernel spec install/tmp/SlicerJupyter-build/inner-build/share/Slicer-4.11/Qt-loadable-modules/JupyterKernel/Slicer-4.9/-replace-user启动笔记本工作在jupyter_envpython -m jupyter笔记本上手动启动核心在斯莱伊萨的计算机编程语言控制台中键入此命令，以手动启动笔记本可以连接到的内核：
connection _ file=r c: Users andra AppData Roaming Jupyter runtime kernel-3100 f53f-3433-40 F9-8978-c 72 ed8 f 88515。JSON print( Jupyter连接文件：[ connection _ file ])切片器。模块。Jupyter内核。启动内核(连接文件)连接文件的路径打印在jupyterNotebook的终端窗口上。
特殊命令这些命令必须是单元格中的最后命令。
_ _内核调试启用():启用所有传入朱皮特请求的详细记录_ _内核调试禁用():启用所有传入朱皮特请求的详细记录
