景观mapping分析图,设计mapping
先来回顾一下之前的文章：【景观生态学】机器猫边编边聊的隐性教程——关于连锁映射器的教程：(1)数据准备
接下来是今天的文章~
02
Linkage Mapper工具箱
啊~ ~ ~说了这么多，终于看到关键词“Linka
ge Mapper
”！看到这个名字你可能还有点疑惑，所以提到最近很流行的“电路理论”
和生态“夹点”
，你大概都知道吧！首先介绍一下联动映射器工具箱和相关原理。(抄袭，我承认)
Linkage Mapper是用于支撑区域野生动物栖息地连通性分析的GIS工具。
它由多个Python脚本组成，打包成ArcGIS工具箱，可以自动绘制野生动物栖息地连接走廊。为了支持华盛顿特区的2010年野生动物栖息地连接工作，开发人员公开使用它来评估其他野生动物的连接性。
Linkage Mapper使用核心栖息地矢量图斑和阻力栅格来绘制核心区域之间的最低成本联系
。阻力网格中的每个单元格都有一个反映能量消耗、移动难度或死亡风险的值。电阻值通常由细胞特征决定，如土地覆盖或房屋密度，并结合特定物种的景观抗性。当动物离开特定的核心栖息地时，成本加权分析将累积总运动阻力图。这些脚本使用ArcGIS和Python函数来识别相邻的核心区域，并在它们之间创建成本最低的走廊地图。这些脚本可以标准化和合并道路地图，并形成一个全面的道路地图。结果表明，每个网格单元在提供核心区域之间的连接方面的相对值允许用户识别哪些走廊遇到了更多或更少的特征，这些特征帮助或阻碍了核心区域之间的移动。
新开发工具的当前版本可用于绘制走廊中的夹点(使用Circuitscape)以及绘制具有高网络中心性的核心区域和走廊。
03
操作教程（大概？）
其实联动映射器工具箱的用户手册很详细，但是！英文手册有时候太晦涩难懂了！因为含蓄的机器猫姐姐菜菜的英语导致翻译问题，运营一度停滞。然后每天遇到困难就去找菌(找他也没用)。大概持续了一个多月吧！终于！我在CSDN上找到了我亲爱的小蛋糕，它抓住了生命线，所以我经历了我知道的联动映射器的操作，分享给大家！科学什么的，自己去发现！(我说了很多废话)
数据准备（啊！又！）
在浅根创建一个文件夹，没有中文！不建议直接放在桌面上，也不会太浅。我就M:lm，把前面准备的源层(source)和综合阻力面(plus1)放到这个文件夹里，哼！数据随时可以撩拨！然后在ArcCatalog中加载文件夹位置！(哈哈哈哈，这是问题的第一步。调用此工具箱不是在打开ArcMap后调用，而是在ArcCatalog中调用。我承认我的菜，第一步就开错了！第一步停了好久！但知道问题出在哪里后，我的旅程就一帆风顺了，啦啦啦啦Xi，多亏了萧肃！)
图2-1 在ArcCatalog中加载
加载文件夹后，可以找到联动映射器工具箱的位置，我们常用的这五个工具都做了标记！我没试过别的，也不知道。不要问我。以后(大概100年后)有时间研究。这些工具我们一个一个来操心吧！
图2-2 常用工具
Linkage Pathways Tool
在这个工具模块下，只有一个工具，即建立网络与地图的联系，字面意思就是建立网络与地图的联系，简而言之就是廊道提取。在链接映射器中，走廊提取也是基于最小成本路径的原则。具体操作步骤和说明请参考说明书中的示意图，非常清楚，具体含义请参考说明书，我就不抄说明书了~ ~ ~
图2-2-2 构建网络和地图链接
点击工具箱，根据提示在弹出的页面中依次加载文件夹lm、source、source ID、综合阻力面。流程步骤部分默认为步骤1、步骤2、步骤3、步骤4就好了，这里是步骤5部分的截断距离，也就是走廊的最大长度设置。一般具体问题具体分析！我在这里定2万！哈哈，然后点击确定，让它运行！运行速度取决于计算机配置和信号源数量。我曾经跑了七八个小时。
图2-3 构建网络和地图链接操作
跑~ ~ ~开心！又可以去划水钓鱼了~ ~ ~啊~ ~看红色标注的地方就知道这个运行时间真的和你的源数有关！(不是说源区不好，我只是想瞎说)
图2-4 等待ing
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa。它还在运行。哎~ ~ ~ ~吃饭吧！啊~ ~ ~吃完饭，赏月，吃月饼。终于跑完了！这就是我想看的。
图2-5 渴望佩戴ing
让我们不安的数字变成哔哔声！直接加载lmoutput文件夹中link_maps数据库中的lm_LCPs行文件。这是最后的结果~ ~ ~数据库中其他文件的意义。看到说明了吗？嗯，看说明书！
图2-6 生态廊道提取结果
很多人说联动映射器可以生成生态流道，而~ ~ ~就是输出文件夹中的LM _ correctors _ truncated _ at _ 20k ~ ~ ~一个带有“宽度”信息的生态廊道，这是联动映射器相比其他方法的优势之一。但是目前这个20k连接宽度截止阈值已经根据经验尝试过很多次了。
图2-7 生态流道
Additionsl Tools
运行这个工具时，需要调用软件Circuitscape，利用电路理论提取生态“夹点”和生态“障碍点”。因此，在运行之前，请确保您的计算机中安装了Circuitscape软件。
还没看完，就等下次分解吧~ ~ ~
分享：Circuitscape安装包，Linakge Mapper工具箱和链接映射器英文手册下载网址：https://circuitscape.org/downloads/
如果不想自己下载，就接受套路，后台回复“LM”。
作者 pbdlh
排版数字阅读菌
校对细菌计数
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